Seit Eröffnung des neuen Museums werden regelmäßig Sonderausstellungen auf der für diese Zwecke reservierten Fläche von 80 qm durchgeführt. Im Einzelnen wurden folgende Ausstellungen gezeigt:
2016: Walter Schmitt, Bildhauerkunst aus Villmar
In der Ausstellung wurde der Bildhauer Walter Schmitt vorgestellt, der über 30 Jahre im Natursteinbetrieb Engelbert Müller in Villmar tätig war. Es wurden Modelle seiner Arbeiten und Originale gezeigt. Walter Schmitt hat für viele bekannte Bildhauer Auftragsarbeiten ausgeführt, beispielsweise das Denkmal des St. Severin von Köln für Prof. Elmar Hillebrand.
2017: Höchste Eisenbahn! Die Kerkerbachbahn in Modell und Dokumenten
Diese Ausstellung zeigte die Geschichte der Kerkerbachbahn, die über viele Jahrzehnte Ton, Basalt und Lahnmarmor vom Westerwald zur Lahntalbahn transportierte. Es wurden Originaldokumente gezeigt. Höhepunkt war der Nachbau des Anschlusses der Bahn an die Lahntalbahn in Steeden mit einer funktionstüchtigen Modelleisenbahn.
2017: Bodenschätze und Bergbau rechts und links der Lahn rund um Villmar
Die Ausstellung zeigte alle Bodenschätze, die im Raum Villmar abgebaut wurden. Hierzu zählen neben dem Lahnmarmor auch Schiefer, Silber, Eisenerz u.a.
2017: Gaia und die vier Elemente
Der frischgebackene Bildhauermeister Eugen Tomme zeigte und erklärte seine Meisterarbeit „Gaia und die vier Elemente“, die einen Bezug zur griechischen Mythologie aufweist. Nach der Ausstellung schenkte er sein Meisterstück aus Lahnmarmor dem Museum.
2017: Marmor lebt
In der Ausstellung zeigten verschiedene Bildhauer ihre Arbeiten aus Marmor, teilweise auch aus Lahnmarmor. Ein Maler der Region präsentierte dazu seine Arbeiten, die alle einen Bezug zum Lahnmarmor hatten. Die Ausstellung stand unter der Schirmherrschaft von Elke Büdenbender, der Ehefrau unseres Bundespräsidenten, die bei der Ausstellungseröffnung persönlich anwesend war.
2018: Die Familie Leonhard – Marmorierer, Steinmetze, Bildhauer mit Tradition
Über 250 Jahre waren Mitglieder der aus Runkel und Villmar stammenden Familie Leonhard als Marmorierer, Steinmetze und Bildhauer tätig. Die Ausstellung zeigte die Familiengeschichte, die eng mit der Geschichte Nassaus verknüpft ist, und die Marmorarbeiten in historischen Bildern. Auch wurden viele Originaldokumente, Originalmodelle und zwei handschriftliche Buchmanuskripte eines Villmarer Marmorierers aus seiner Soldatenzeit in der Nassauischen Armee in der Zeit um 1815 ausgestellt.
2019: Faszination Kalk
Zusammen mit dem Bundesverband der Deutschen Kalkindustrie und der SCHAEFER KALK GmbH & Co. KG, Diez wurde der Rohstoff Kalk präsentiert. Die Ausstellung wurde in enger Abstimmung mit der Schulverwaltung der Kreise Limburg-Weilburg und Wetzlar vorbereitet. Umfangreiches Begleitmaterial stand insbesondere für die Schulen zur Verfügung.
2020/2021: Prof. Elmar Hillebrand – Ein Kölner Bildhauer in Villmar
Über 50 Jahre arbeitete Prof. Elmar Hillebrand, ein Absolvent der Düsseldorfer Kunstakademie und Professor an der TH Aachen, mit dem Natursteinbetrieb Engelbert Müller in Villmar zusammen. Vieler seiner europaweit bekannten Arbeiten, die häufig von Bildhauer Walter Schmitt ausgeführt worden sind, entstanden in dieser Werkstatt.
2021/2022: Leidenschaft Lahnmarmor
Steinmetz Gerhard Höhler, ein Urgestein aus Villmar, arbeitet für sein Leben gern mit dem Material Lahnmarmor. Die Ausstellung zeigt einen Querschnitt seiner Arbeiten.
2022: Die drei Leben des Unica
In diesem Jahr werden auf der Sonderausstellungsfläche die „Drei Leben des Unica“ gezeigt. In der Ausstellung wird erklärt, wie der heutige Lahnmarmor vor 380 Mio. Jahren entstanden ist, wie er rund 400 Jahre abgebaut wurde und wie er vor gut 30 Jahren als geologisches Highlight wiederentdeckt worden ist.